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就在飞艇持续航行的过程中，一阵剧烈的震动吸引了所有人的注意。
“这是怎么回事？！”海马大声喊道:“快点将船稳定下来。”
什么情况？
正在睡觉的游铭突然感觉到，突然决斗艇传来阵阵剧烈的抖动！一觉醒来就听到海马的大喊声。
“地震！”
游铭不由的想起这两个字，想到这里他便立刻起身，向外冲去！
刚走到门口，游铭就停下了脚步，自感无语。
“这不是在飞艇上吗？哪来的地震！”游铭突然想到了这是在天上。
“不好了，飞艇好像都出事故了！”城之内大吼大叫的跑出来。
城之内的大喊声将船舱内睡着的人都惊醒，游戏，杏子，本田等人都已从自已休息的地方走了出来。
“到底发生了什么事？”城之内见游铭站在那里向其询问道。
“我也不清楚！”游铭道:“海马应该在驾驶舱，我们一起去看看吧！”
游铭和游戏一伙人前往驾驶舱！
在路上，游铭回想起游戏王的剧情，发现这正是乃亚篇的剧情，海马刚三郎的亲生儿子，相貌与海马濑人十分相似。从小海马乃亚就受到了英才教育，并且还进入其他的领域。
但是由于一场车祸，海马刚三郎将乃亚的人格数据移动到了海马公司的军事用作战电脑AI中，使乃亚只能依靠机器存活。
在乃亚篇的时候，乃亚利用了海底的巨大要塞将决斗艇带到海中，并且还在虚拟世界中展开了决斗，伙同海马公司原本的五巨头，想要击垮海马濑人。
虽然这个击败方法是靠打牌，不过乃亚虽然是靠打牌决胜负，但跟传统上的卡牌决斗是有区别的！
其主要就表现在乃亚引入了“卡组统领”的新规则。
双方玩家从卡组里面选择一张怪兽卡当做：卡组统领，被选择的怪兽卡可以无视效果特殊召唤，而且卡组统领还有一些特殊效果。
不过，卡组统领一旦被破坏，玩家就会被判输。
在游民游戏等众人来到驾驶舱后，整个驾驶舱的屏幕也出现一个长着绿色头发和海马，有些相似的小孩。这人就是海马乃亚！
“欢迎各位决斗者的到来！”乃亚道:“我等你很久了，濑人！”
“你是谁？到底是打什么主意？”海马质问道！
“让我好好招待你们吧！”乃亚说完，就断开了和飞艇的联系，影像从屏幕上消失！
“轰，”巨大的声响，一艘巨大的潜艇从海里冒出。
“哦，好大！”
“好长啊！”
“居然长这么粗！”
“如同怪物一般狰狞！”城之内，本田两人惊呼道。
在乃亚劫持下，飞艇进入水下基地，用武力逼迫众人下船，让他们不知不觉间进入了虚拟的数字世界中。
不过也并不是所有人都被放下船来了，像伊西斯这种可以看穿未来的人，就留在了船上，顺便可以照顾她躺在床上的弟弟马利克。
